7月31日至8月2日，鑒于中國(guó)科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所近年來(lái)對(duì)微生物的測(cè)序量大、研究生對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)的分析和信息挖掘不熟悉，造成微生物測(cè)序數(shù)據(jù)的發(fā)表相對(duì)滯后，應(yīng)該所孔祥峰研究員和所青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)的邀請(qǐng)，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)消化道微生物研究團(tuán)隊(duì)的成艷芬副教授，到該所進(jìn)行微生物16S高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析及作圖培訓(xùn)。
成艷芬首先介紹了微生物菌群結(jié)構(gòu)的分析方法以及Unix基礎(chǔ)知識(shí)，之后講解了Miseq數(shù)據(jù)質(zhì)量控制與分析方法、序列OTUs聚類分析與注釋，以及數(shù)據(jù)多樣性分析（α，β）及差異比較分析，最后詳細(xì)介紹了R/Rstudio可視化作圖的方法與注意事項(xiàng)。會(huì)后，成艷芬耐心解答了參會(huì)人員在實(shí)際數(shù)據(jù)分析過(guò)程中所遇到的問(wèn)題，并給予了指導(dǎo)性的建議。整個(gè)講座內(nèi)容與大部分科研人員的研究緊密銜接，實(shí)用性強(qiáng)，與會(huì)人員紛紛表示收獲很大，希望以后開展更多類似的培訓(xùn)講座。
據(jù)悉，成艷芬博士長(zhǎng)期從事動(dòng)物消化道微生物菌群結(jié)構(gòu)及功能研究。2015-2016年赴美國(guó)俄勒岡州立大學(xué)微生物系學(xué)習(xí)消化道微生物生物信息學(xué)分析技術(shù)，熟練掌握R、Perl、Python、PHP等計(jì)算機(jī)腳本語(yǔ)言，熟悉消化道微生物高通量、宏基因組、宏轉(zhuǎn)錄組、基因組及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程。目前負(fù)責(zé)南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院及消化道微生物實(shí)驗(yàn)室服務(wù)器的運(yùn)行與維護(hù)工作，并建立了完善的消化道微生物高通量數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。
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